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天津位于渤海湾西北部,海岸线长,牡蛎生物量大,但是关于天津海区牡蛎种类组成未见有详细报道。为了解此地区牡蛎物种多样性情况,本研究对天津沿海自南至北5个地点随机采集了约230个野生牡蛎,结合形态学和分子生物学手段,利用种特异性(Species-specific)PCR分子标记及COI基因序列详细地分析了牡蛎物种组成。种特异性PCR可以快速鉴定并确认牡蛎种类,结果表明天津沿海牡蛎优势种为北方常见种长牡蛎Crassostrea gigas gigas,另外一种不能通过种特异性PCR确定,但经形态鉴定及COI基因片段的Genbank Blast比对,确定其为猫爪牡蛎Crassostrea talonata。综合形态学和分子生物学手段,研究结果表明大神堂有长牡蛎和猫爪牡蛎两种牡蛎,其余4个地点的牡蛎均为长牡蛎。总体来看,天津沿海牡蛎物种多样性较低,这与北方沿海潮间带牡蛎生长的生态环境如水温、盐度等有关。本研究采集的牡蛎个体普遍偏瘦小,可能与沿海频繁的人为采捕有关,此结果为我国天津沿海牡蛎的种类、分布及其他相关研究提供了参考,为野生牡蛎的合理保护提供了依据。 相似文献
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基于线粒体COI序列莱州湾单环刺螠遗传多样性分析 总被引：1，自引：1，他引：0
为系统地了解莱州湾单环刺螠(Urechis unicinctus)遗传多样性,作者基于线粒体COI序列利用基因测序技术研究了莱州湾3个单环刺螠不同群体的遗传多样性。实验结果显示,84个莱州湾单环刺螠样本有变异位点数125个,其中包括43个单一变异位点,82个简约信息位点;48个单倍型,单倍型多样性0.977;核苷酸多样性指数0.01048;平均核苷酸差异数量13.725;莱州湾单环刺螠遗传多样性水平较高;个体聚类并没有体现出和地理位置相关。 相似文献
56.
对中国华南沿海不同地理群体的黄斑篮子鱼(Siganus oramin)进行遗传多样性分析, 测定了漳州东山湾(DS)、深圳大亚湾(DY)、深圳大鹏湾(DP)、阳江沙扒湾(SB) 4个群体共计100尾黄斑篮子鱼线粒体DNA D-loop序列。结果显示: 序列长度约828bp, 包含72个变异位点, 50个单倍型, A、T、C、G含量平均为31.2%、31.1%、20.8%和16.9%; 单倍型多样性指数为0.893±0.053~0.957±0.030, 核苷酸多样性指数为0.0105±0.0031~0.0179±0.0031, 表现为高单倍型多样性而低核苷酸多样性的特点; 群体内的遗传距离0.0107~0.0184, 群体间的遗传距离0.0112~0.0172, AMOVA分析显示群体间的分子变异占0.66%, 群体内占99.34%; 中性检验结果表明Fu’s Fs检验值为显著的负值(-16.7079, p<0.01); 核苷酸不配对分布图呈单峰, 表明黄斑篮子鱼演化过程中经历过种群扩张事件, 推测扩张时间约在1.38~4.60万年前。综上, 华南沿海岸4个黄斑篮子鱼群体间不存在显著的遗传分化, 可划归一个管理单元, 而沙扒湾(SB)群体遗传多样性水平相对较高, 应优先加以保护。 相似文献
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通过对四个中华鳖(Pelodiscus sinensis)养殖品系(太湖品系、台湾品系、日本品系、黄河品系)的线粒体部分序列进行测序对比,筛选出不同品系中华鳖的品系特异性SNP位点,并设计特异性引物,利用高分辨率熔解曲线法进行SNP分型与鉴定。结果表明,所设计的7对引物组均可扩增出80—150bp大小不等的中华鳖线粒体序列,并成功用于中华鳖的SNP分型。在这7个位点中,其中可鉴定中华鳖日本品系和太湖品系的各1个,可鉴定台湾品系的有2个,可鉴定黄河品系的有3个。此方法能够快速、简便地鉴别以上四个中华鳖品系,为鉴别市场中出现的假冒鳖,并指导品种选育工作提供技术支持。 相似文献
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The increasing exploitation of mangrove forests, without any sustainable planning, has been seriously compromising the survival of this ecosystem and of its exclusive resources. Scylla serrata is one of the most commercially exploited crabs inhabiting mangroves and estuaries of the Indo-Pacific region. This species is extensively harvested, mainly for selling to the tourist market, and, as a consequence, its populations are in constant decline. The aim of the present study was to assess the level of genetic exchange of S. serrata within the Western Indian Ocean (WIO), using a population genetic structure approach. To achieve this goal, we reconstructed the intra-specific geographic pattern of genetic variation by partial sequencing the mitochondrial DNA cytochrome oxidase subunit I, in samples from seven mangrove sites of the WIO. Our data set then encompassed all the sequences for the same genetic marker deposited in Genbank and corresponding to samples from South East Asia, Australia and some Pacific Islands: this allowed us to estimate the level of connectivity among S. serrata populations within its distribution area. 相似文献
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在形态学和分子生物学(28S rRNA、COI部分序列)分析的基础上,对我国北方典型海区辽宁丹东,山东烟台、威海,江苏连云港的常见镜蛤进行了取样和分类地位的研究。结果表明:日本镜蛤(Dosinia japonica)、薄片镜蛤(Dosinia corrugata)和饼干镜蛤(Dosinia biscocta)为我国北方沿海潮间带常见且大量分布的种类,其中饼干镜蛤与日本镜蛤的遗传距离比较接近(以较高支持率聚为一支)。连云港的饼干镜蛤以及丹东的薄片镜蛤的不同个体间存在差异,对这两地区的样品还有待作进一步的研究。 相似文献
60.
Brackish water ecosystems are often exposed to wide variations in environmental variables, including temperature and salinity, which may cause strong selective pressures on organisms modifying the genetic patterns of species. The aim of this work was to test whether there is a ‘divergence-with-gene flow’ in coastal lagoon populations of white seabream (Diplodus sargus) (Ria Formosa, S Portugal and Mar Menor, SE Spain) respect to four marine populations, by using partial sequences of cyt b mitochondrial gene and information from nine microsatellite loci. Genetic diversity was highest in both coastal lagoons (Mar Menor and Ria Formosa) considering mitochondrial and nuclear markers. Although some of FST population pairwise comparisons were not significant, analyses of molecular variance (AMOVAs) detected differences between groups (coastal lagoon and marine) close to significance. Also, only two haplotypes (Cytb-17 and Cytb-18) were detected in both coastal lagoon sampling sites and these localities (Mar Menor and Ria Formosa) showed the highest number of singletons, some of them with a high number of mutations, as has been already described for other Mar Menor populations (Pomatochistus marmoratus and Holothuria polii). Also, several tests detected significant positive and balancing selection considering mtDNA and microsatellite data. These data support the hypothesis of selection as one of the drivers of the genetic differences found between coastal lagoon and marine populations. The life strategy adopted by Diplodus sargus in coastal lagoons allows it to decrease its mortality rate and improve the heritability of its genes. Also, the increase time spent in coastal lagoons with different temperatures and salinities favours the fitness selection and the maintenance of exclusive haplotypes and genotypes in coastal lagoon inhabitants favouring the ‘divergence-with-gene-flow’. 相似文献